Fakultas Tarbiyah dan Ilmu Keguruan (FTIK) pada awalnya merupakan salah satu fakultas yang ada di Perguruan Tinggi Institut Islam Nahdlatul Ulama (INISNU) Jepara di bawah naungan Yayasan INISNU Jepara (Akte Yayasan No 50 dari Notaris Benjamin Kusuma SH) pada Juli 1989, yang saat itu bernama Fakultas Tarbiyah, sesuai dengan Ijin dari Kopertais Wilayah X Jawa Tengah. Kemudian pada tahun 2013, UPPS menjadi Fakultas Tarbiyah dan Ilmu Keguruan sesuai dengan SK menteri Pendidikan dan Kebudayaan Nomor 149/E/O/2013 di bawah naungan Yayasan YAPTINU Jepara (yang semula bernama yayasan INISNU Jepara). Institut Islam Nahdlatul Ulama (INISNU) Jepara, bersama dua institusi yang lain, yaitu STIENU dan STTDNU pada tahun 2013, bergabung menjadi satu dan berubah nama menjadi Universitas Islam Nahdlatul Ulama (UNISNU) Jepara berdasarkan SK Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Nomor 149/E/O/2013.

Sejak berdirinya sampai tahun 2013 FTIK hanya memilki satu program studi yaitu PS Pendidikan Agama Islam (PAI). Pada tahun 2013 menambah satu prodi baru yaitu Program Studi Pendidikan Bahasa Inggris (PBI) dibuka pada tahun 2013 berdasarkan SK Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Nomor 149/E/O/2013.  Prodi Pendidikan Guru Anak Usia Dini (PG PAUD) didirikan pada tahun 2016 berdasarkan SK Menristek Nomor 247?KPT/I/2016 tanggal 26 Agustus 2016.dan pada tahun yang sama dibuka Prodi Pendidikan Guru Sekolah Dasar (PGSD) berdasarkan SK Kementerian Riset, Teknologi dan Pendidikan Tinggi Nomor 470/KPT/I/2016.

Menjadi fakultas yang unggul dalam bidang pendidikan dan ilmu keguruan, yang menghasilkan sarjana yang unggul, cendekia, berakhlakul karimah dan berkepribadian ahlussunnah wal jama'ah pada tahun 2028.